一、TT病毒国内外研究进展(论文文献综述)
陈柯[1](2021)在《两株猪细环病毒的全基因组测序及分析》文中进行了进一步梳理猪细环病毒(Torque teno sus virus,TTSuV)是一种小型环状单链负性DNA病毒,在猪群中广泛流行,目前有两种不同基因型感染猪群,两种基因型均可通过垂直和水平传播,且体内病毒含量随着年龄的增长有增加趋势。近年来,随着研究者对该病毒不断深入研究发现,TTSuV感染健康动物的比例逐渐增高,病毒自身感染后并不会立即引起疾病发生,但是该病毒会使猪只机体抵抗其他疾病的能力下降。尽管该病毒的致病性尚不能确定,但已有试验表明TTSuV对猪群高致病性病原体具有促进作用,给我国养殖行业造成重大的经济损失。为了解河南地区猪源TTSuV的遗传多样性,本研究对河南某养殖场采集的11份TTSuV组织病料进行PCR检测,将检测阳性的组织进行全基因组扩增,对扩增出的TTSuV全基因组序列进行遗传学分析,在线软件预测分析ORF1蛋白理化性质及基本结构;并将阳性样品进行病毒分离培养。结果发现TTSuV可在Marc145细胞上成功传代培养,为后续更好的了解TTSuV的遗传变异和生长特性提供数据支持,其致病性需进一步研究。使用PCR方法对10份阳性样品进行全基因组扩增,成功扩增出2株TTSuV1全基因组序列,使用生物信息学软件分析显示,2株分离株之间核苷酸相似性仅有86.2%,推导氨基酸相似性为77.7%;2株分离株与TTSuV1参考毒株核苷酸之间相似性在70.3%~96.0%之间,推导氨基酸相似性在56.2%~90.9%之间,与TTSuVk2参考毒株核苷酸之间相似性小于50%。与不同亚型参考毒株共同构建系统发育进化树,发现2株分离株均与TTSuV1c亚型毒株亲缘关系较近,处于同一分支,即2株分离株均为TTSuV1c亚型。基因重组软件分析发现,2株TTSuV1分离株均存在基因重组现象,且重组区域相似,西班牙株G21株为亲本毒株,中国LNJZ株提供重组片段。重组区域位于ORF1与ORF3部分重叠区域,He N1-A9重组位点位于2195~2530 bp,He N1-A11重组位点位于2147~2650 bp。使用Net NGlyc1.0、Net OGlyc3.1和Net Phos2.0等在线软件对2株TTSuV1分离株ORF1蛋白进行结构预测,结果显示,2株分离株ORF1均由648位氨基酸组成,不含有O糖基化位点,二级结构主要由α-螺旋、β-折叠、无规则卷曲等组成,He N1-A9毒株含有4个糖基化位点和23个潜在的磷酸化位点,而He N1-A11含有1个N糖基化位点和35个潜在的磷酸化位点。对TTSuV1检测阳性的组织病料进行病毒分离,将10份阳性样品分别感染Marc145细胞进行病毒分离培养,He N1-A9毒株盲传至第5代观察到明显细胞病变(CPE),进行半数组织细胞感染量(TCID50)的测定和动物致病性实验,结果表明,He N1-A9病毒株毒价约为105.0 TCID50,以2 m L 105.0TCID50/m L的TTSuV1病毒液对21 d仔猪进行攻毒,攻毒7 d后采血PCR检测TTSuV1阳性,进行序列测定,确定为He N1-A9毒株。饲养至28 d,未发现任何临床症状,剖检无明显病变。
边静,张锋,陈博,刘凤华[2](2011)在《保定市在校大学生TTV重叠感染状况调查》文中进行了进一步梳理目的了解保定市高校大学生中不同人群TT病毒的感染状况。方法采用半巢式聚合酶链反应(semi-nested PCR)对健康人群、肝炎患者及HCV感染者等5组人群血清进行TTV DNA检测。结果保定市高校大学生中不同人群血清TTV DNA总阳性率17.6%,健康人群血清TTV DNA阳性率9.3%。其他人群血清TTV DNA阳性率由高到低依次为丙型肝炎组31.6%、乙型肝炎组26.9%、急性甲型肝炎组16.7%、HCV感染组9.3%。急性甲型肝炎组、HCV感染组血清TTV DNA阳性率与健康人群比较差异无统计学意义(P>0.05);丙型肝炎组、乙型肝炎组血清TTV DNA阳性率与健康人群比较差异有统计学意义(P<0.01)。结论大学生中广泛存在TTV感染组,丙型肝炎、乙型肝炎患者的感染率较高。
刘志伟[3](2011)在《上海和内蒙古地区输血性传播病毒的流行病学调查及ORF1基因的克隆表达》文中进行了进一步梳理输血型传播病毒(Torque Teno virus,TTV)是由Nishizawa[1]于1997年在研究原因不明肝炎患者的过程中,用RDA(代表性差异技术)方法从一名58岁的日本患者血液中分离到的一种病毒,是继甲、乙、丙、丁、戊、己、庚之后的又一肝炎病毒--辛型肝炎病毒,从属与指环病毒科(Anellovirida)。该病毒为单股环状DNA,病毒基因组长度在2.1-3.9 KB之间,有两个主要的开放阅读框(ORF),ORF1可能编码病毒的主要结构蛋白,ORF2主要编码非结构蛋白。TTV能感染人、非人灵长类、猪、犬、猫、牛、羊、骆驼等哺乳动物,对禽类的感染也有报道,但是,TTV的大小及特性在不同物种中差异较大,仅人的TTV就存在40多个基因型。TTV感染范围较宽,传播途径较广,与人类隐性肝病密切相关,因此引起了世界各国学者的广泛关注。本试验根据GeneBank公开发表的SAa-10(AB060594)全序列设计型特异性引物,通过巢式PCR方法检测来自上海某儿童医院的150份、年龄在1个月到8岁之间的儿童粪样和109份成年人血样,来自内蒙的96份中老年人的粪样,结果发现:内蒙96份中老年人粪样中没有阳性样品,上海150份儿童粪样中检测到3份,上海109份血样中有8份阳性,阳性样品的序列与SAa-10序列以及不同阳性样品序列间的同源性均在90%以上,说明TTV的感染不存在地域差异性,但是,感染率可能与年龄有一定的相关性。参照SAa-10(AB060594)对其中一份阳性样品进行全序列扩增,命名为L-SH (HM224451),通过Cluster比对及Mega 4.0进行进化树分析表明,本实验分离株L-SH (HM224451)与日本株SAa-10(AB060594)的同源性达93.8%,进一步说明了同一基因型TTV之间不存在地域差异。对分离株L-SH ORF1中的蛋白,运用DNA-Star中Protean软件进行抗原表位分析,选取抗原表位密集的区域设计引物进行扩增,并连接到表达载体PET-30中,经IPTG诱导表达。结果发现,此蛋白能高效表达并以包涵体形式存在,为后续TTV的ELISA检测和疫苗抗原的研究进行有意义的探索。
李阳,肖洁,蒲晓允[4](2006)在《TTV检测方法研究进展》文中提出
李庆平,侯佩强[5](2006)在《TT病毒研究进展》文中指出
张华东[6](2006)在《TT病毒的检测及与肝病关系的临床研究》文中进行了进一步梳理背景和目的 病毒性肝炎是对人类健康危害严重的传染病之一,目前已发现并确认的肝炎病毒有甲、乙、丙、丁、戊、庚6种,但仍有10%~20%的肝炎患者找不到任何已知的血清学肝炎病毒感染标志,肝炎病人病因不明,提示尚存在其它未被发现的肝炎病毒。1997年底,日本的Nishizawa等使用代表性差异分析法(representational difference analysis,RDA)从一名姓名为TT的输血后非甲~庚型肝炎患者血清中克隆到一段与目前已知的任何DNA序列都没有明显同源性的未知DNA序列,证实其与输血后肝炎高度相关,并把该基因片段可能代表的病毒以病人的名字命名为TT病毒(TTV)。目前我国对TTV的感染流行情况、基因检测分型等有初步报道,但各地对TTV的感染率报道差别较大,特别是和国外的相关报道差别更为明显。本课题旨在探讨TTV在东营地区的感染情况、TTV的传播途径、TTV和人类肝病的关系,以及TTV是否为非甲~非庚肝炎的致病因子、致病特征等。 方法 目前TT病毒的诊断和分型依赖聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)。对PCR扩增后获得产物采用核酸杂交、酶切和测序的方法来判断分析结果。我们采用微板核酸杂交酶免疫方法对TTV基因扩增产物进行定性检测。由于TTV在血清中的含量很低,我们在检测过程中进行了二次PCR扩增,对第二次产物通过琼脂糖凝胶电泳定性鉴定。然后对阳性结果再获得一次产物,应用双探针杂交技术,用ELISA法进行确认TTV DNA。 统计方法:应用SPSS软件包对数据进行处理,采用χ2检验及方差分析进行统计分析。 结果
金生,游苏宁,张大志,任红[7](2005)在《编辑在提高科技期刊学术质量中的作用》文中指出科技期刊学术质量的提高并不仅仅取决于研究领域科研水平的高低,编辑也有重要作用。编辑应准确选题,保证期刊发挥学术导向作用;严格初审,保证期刊的全面质量;认真加工,保证文稿的科学性和规范性;仔细核查,保证参考文献的准确引用。编辑应与科研工作者共同提高科学研究的水平和科技期刊的质量。
黎新平,缪沄,柳华芬,王红依,裘爱国[8](2005)在《TT病毒研究进展与存在问题回顾》文中研究指明
张荣梅[9](2003)在《TT病毒致病性研究进展》文中研究指明 TT病毒(TT virus,TTV)自1997年末日本学者Nishizawa等报道之后,几年来,国内外学者对TTV的生物学特性、基因序列与分类分型、感染与传播、检测方法及致病性等作了大量的研究,并取得了显着进展,本文主要对该病毒致病性方面的研究进展简要综述。
彭宜红,庄辉[10](2003)在《TT病毒研究进展》文中提出
二、TT病毒国内外研究进展(论文开题报告)
(1)论文研究背景及目的
此处内容要求:
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例:
本文主要提出一款精简64位RISC处理器存储管理单元结构并详细分析其设计过程。在该MMU结构中,TLB采用叁个分离的TLB,TLB采用基于内容查找的相联存储器并行查找,支持粗粒度为64KB和细粒度为4KB两种页面大小,采用多级分层页表结构映射地址空间,并详细论述了四级页表转换过程,TLB结构组织等。该MMU结构将作为该处理器存储系统实现的一个重要组成部分。
(2)本文研究方法
调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
三、TT病毒国内外研究进展(论文提纲范文)
(1)两株猪细环病毒的全基因组测序及分析(论文提纲范文)
摘要 |
Abstract |
第一章 文献综述 |
1.1 猪细环病毒的研究进展 |
1.2 猪细环病毒病原学特点 |
1.3 猪细环病毒的基因组结构功能 |
1.4 猪细环病毒流行病学特点 |
1.5 猪细环病毒的理化特性 |
1.6 猪细环病毒致病特性 |
1.7 猪细环病毒含量分布 |
1.8 猪细环病毒的潜在应用价值 |
1.9 猪细环病毒细胞培养特性 |
1.10 生物学诊断 |
1.10.1 病原学检测 |
1.10.2 血清学检测 |
1.11 全基因组研究 |
1.12 研究目的及意义 |
第二章 猪细环病毒全基因组克隆测序及分析 |
2.1 主要实验材料 |
2.1.1 主要试剂 |
2.1.2 主要仪器 |
2.2 实验室常用溶液配制 |
2.3 实验方法 |
2.3.1 临床病料与处理 |
2.3.2 病毒总基因组提取 |
2.3.3 引物设计及合成 |
2.3.4 猪细环病毒RT-PCR检测 |
2.4 猪细环病毒全基因组序列扩增 |
2.4.1 全基因组引物设计与合成 |
2.4.2 猪细环病毒阳性样品基因组提取 |
2.4.3 猪细环病毒全基因组序列扩增 |
2.4.4 阳性PCR产物回收纯化 |
2.4.5 目的片段的连接 |
2.4.6 目的基因转化 |
2.4.7 重组菌株PCR鉴定 |
2.4.8 猪细环病毒全基因组序列分析 |
2.4.9 ORF1 序列生物信息学分析 |
2.5 结果与分析 |
2.5.1 样品检测结果 |
2.5.2 TTSuV全基因组扩增结果 |
2.5.3 优化克隆转化过程 |
2.5.4 TTSuV全基因组序列拼接 |
2.5.5 TTSuV全基因组相似性分析 |
2.5.6 基因重组分析 |
2.5.7 ORF1 蛋白理化性质预测分析 |
2.5.8 ORF1 蛋白二级结构预测 |
2.6 结论与讨论 |
第三章 猪细环病毒分离及仔猪致病性试验 |
3.1 主要实验试剂 |
3.2 主要试验仪器 |
3.3 实验材料 |
3.4 猪细环病毒分离培养 |
3.4.1 实验材料 |
3.4.2 细胞复苏 |
3.4.3 细胞传代培养 |
3.4.4 细胞冻存 |
3.4.5 6 孔板培养细胞 |
3.4.6 病毒分离 |
3.4.7 96 孔板培养细胞 |
3.4.8 半数组织感染量(TCID_(50))的测定 |
3.4.9 动物致病性试验 |
3.5 结果与分析 |
3.5.1 病毒分离培养 |
3.5.2 分离株毒价测定 |
3.5.3 动物致病性试验 |
3.6 结论与讨论 |
第四章 展望 |
参考文献 |
附录 本研究涉及所有参考毒株信息 |
攻读硕士学位期间取得的研究成果 |
致谢 |
(2)保定市在校大学生TTV重叠感染状况调查(论文提纲范文)
1 材料与方法 |
1.1 研究对象 |
1.2 肝功能和肝炎病毒感染指标的检测 |
1.3 TTV DNA检测 |
1.3.1 主要试剂及仪器 |
1.3.2 引物设计 |
1.3.3 检测方法 |
1.3.4 统计学处理 |
2 结果 |
3 讨论 |
(3)上海和内蒙古地区输血性传播病毒的流行病学调查及ORF1基因的克隆表达(论文提纲范文)
摘要 |
Abstract |
1 引言 |
1.1 发展简史 |
1.2 TTV 作为一种新型肝炎病毒的发现 |
1.2.1 历史 |
1.2.2 理化性质 |
1.2.3 单链环状 DNA 病毒 |
1.2.4 TTV 的变异 |
1.3 流行病学 |
1.3.1 感染途径 |
1.3.2 TTV 在不同人群中的感染率 |
1.3.3 地区分布 |
1.4 TTV 的检测方法 |
1.5 TTV 和它的潜在致病性 |
1.5.1 肝脏疾病 |
1.5.2 血液疾病 |
1.5.3 肺部疾病 |
1.5.4 特发性炎症性肌病 |
1.5.5 免疫抑制 |
1.5.6 系统性红斑狼疮 |
1.6 动物 TTV |
1.6.1 非人灵长类的 TTV |
1.6.2 其他动物的 TTV |
1.7 本研究的目的与意义 |
2. 上海地区和内蒙古呼和浩特市地区人 TTV 的流行病学调查 |
2.1 材料 |
2.1.1 样品 |
2.1.2 主要试剂 |
2.1.3 主要仪器 |
2.2 试验方法 |
2.2.1 引物的设计与合成 |
2.2.2 样品处理 |
2.2.3 DNA 模板的制备 |
2.2.4 目的片段的扩增 |
2.2.5 PCR 产物的凝胶电泳检测 |
2.2.6 PCR 产物凝胶回收 |
2.2.7 回收产物与pMD18-T 载体连接反应 |
2.2.8 转化及测序 |
2.3 结果与讨论 |
2.3.1 样品中TTV 第20 型 SAa-10 的检测 |
2.3.2 讨论 |
3. TTV 基因的全长扩增 |
3.1 主要试剂和仪器 |
3.1.1 主要试剂 |
3.1.2 主要仪器 |
3.1.3 材料 |
3.1.4 引物设计 |
3.2 试验方法 |
3.2.1 PCR 扩增 |
3.2.2 电泳 |
3.2.3 PCR 产物凝胶回收 |
3.2.4 回收产物与pMD18-T 载体连接反应 |
3.2.5 转化及测序 |
3.3 结果与分析 |
3.3.1 结果 |
3.3.2 进化分析 |
3.4 讨论 |
4. TTV ORF1 基因的原核表达载体的构建和表达蛋白的纯化 |
4.1 材料 |
4.1.1 样品、菌株和质粒 |
4.1.2 主要试剂 |
4.1.3 主要仪器 |
4.2 试验方法 |
4.2.1 引物的设计与合成 |
4.2.2 PCR 扩增 |
4.2.3 目的片段的回收 |
4.2.4 目的基因的克隆 |
4.2.4 克隆质粒的构建 |
4.2.5 原核表达载体PET-30a-ORF1 的构建 |
4.2.6 重组表达载体的诱导表达 |
4.2.7 最优表达时间的确定 |
4.2.8 表达产物的纯化 |
4.2.9 表达产物的复性 |
4.3 结果 |
4.3.1 ORF1 基因的 PCR 结果 |
4.3.2 目的基因的克隆鉴定 |
4.3.3 重组表达载体的鉴定 |
4.3.4 蛋白原核表达及最优表达时间的确定 |
4.3.5 蛋白的可溶性分析 |
4.3.6 蛋白的纯化与复性 |
4.4 讨论 |
5. 结论 |
6. 展望 |
致谢 |
参考文献 |
作者简历 |
(4)TTV检测方法研究进展(论文提纲范文)
1 TTV概况 |
2 TTV的检测方法进展 |
2.1 TTV DNA的检测 TTV DNA的检测主要依赖PCR技术。 |
2.2 TTV分型的检测 |
2.3 TTV的其他检测方法 |
2.3.1 血清免疫学法 |
2.3.2 原位杂交法 |
3 结 语 |
(6)TT病毒的检测及与肝病关系的临床研究(论文提纲范文)
摘要 |
Abstract |
符号说明 |
第一部分 TTV检测及东营地区的流行病学研究 |
前言 |
材料和方法 |
一、调查人群和标本来源 |
二、试剂 |
三、主要仪器 |
四、实验项目和检测方法 |
结果 |
一、正常人群血清TTV DNA阳性率及性别间差别比较 |
二、TTV DNA阳性率的年龄趋势 |
三、母婴TTV的垂直传播率和6月龄婴幼儿的感染率 |
讨论 |
一、TTV的发现和基本特征 |
二、流行病学研究 |
结论 |
参考文献 |
第二部分 TTV与人类肝病关系的研究 |
前言 |
材料和方法 |
一、检查人群和标本来源 |
二、试剂 |
三、主要仪器 |
四、实验项目和检测方法 |
结果 |
一、不同类型病毒性肝炎的TTV DNA阳性率 |
二、TTV DNA在不明转氨酶升高、肝炎、肝硬化、肝癌中的阳性率 |
讨论 |
一、TTV在人体的分布 |
二、TTV与甲-戊型肝炎的关系 |
三、TTV与不明转氨酶升高、肝硬化、肝癌的关系 |
结论 |
问题与展望 |
参考文献 |
综述 |
一、TTV的发现 |
二、TTV的分子生物学特征 |
三、TTV的分布 |
四、TTV的传播途径 |
五、TTV的易感人群 |
六、TTV的病理学研究 |
七、TTV感染的临床表现 |
八、TTV的检测方法 |
九、治疗对策 |
十、展望 |
参考文献 |
附图 |
发表论文目录 |
致谢 |
(7)编辑在提高科技期刊学术质量中的作用(论文提纲范文)
1 准确选题, 保证期刊发挥学术导向作用 |
2 严格初审, 保证期刊的全面质量 |
3 认真加工, 保证文稿的科学性和规范性 |
4 仔细核查, 保证参考文献准确引用 |
5 结语 |
(9)TT病毒致病性研究进展(论文提纲范文)
1 TTV的主要生物学特点 |
2 TTV分型与分类 |
3 TTV在人群中的传播与感染状况 |
4 有关TTV致病性的研究 |
(10)TT病毒研究进展(论文提纲范文)
TTV分子生物学研究 |
TTV检查方法的研究 |
TTV分类学研究 |
TTV基因分型研究 |
TTV的感染、传播及免疫性 |
四、TT病毒国内外研究进展(论文参考文献)
- [1]两株猪细环病毒的全基因组测序及分析[D]. 陈柯. 南阳师范学院, 2021(11)
- [2]保定市在校大学生TTV重叠感染状况调查[J]. 边静,张锋,陈博,刘凤华. 医学研究与教育, 2011(05)
- [3]上海和内蒙古地区输血性传播病毒的流行病学调查及ORF1基因的克隆表达[D]. 刘志伟. 内蒙古农业大学, 2011(11)
- [4]TTV检测方法研究进展[J]. 李阳,肖洁,蒲晓允. 重庆医学, 2006(18)
- [5]TT病毒研究进展[J]. 李庆平,侯佩强. 中国卫生检验杂志, 2006(04)
- [6]TT病毒的检测及与肝病关系的临床研究[D]. 张华东. 山东大学, 2006(12)
- [7]编辑在提高科技期刊学术质量中的作用[J]. 金生,游苏宁,张大志,任红. 编辑学报, 2005(04)
- [8]TT病毒研究进展与存在问题回顾[J]. 黎新平,缪沄,柳华芬,王红依,裘爱国. 实用医学杂志, 2005(10)
- [9]TT病毒致病性研究进展[J]. 张荣梅. 医学理论与实践, 2003(12)
- [10]TT病毒研究进展[J]. 彭宜红,庄辉. 中华微生物学和免疫学杂志, 2003(04)